Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Znf428Q8C1M2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf428Q8C1M2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf428Q8C1M2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf428Q8C1M2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf428Q8C1M2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms