Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms