Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms