Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms