Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc30Q8BVF4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc30Q8BVF4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc30Q8BVF4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc30Q8BVF4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc30Q8BVF4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc30Q8BVF4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ccdc30Q8BVF4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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