Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rbfox3Q8BIF2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms