Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubash3bQ8BGG7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubash3bQ8BGG7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubash3bQ8BGG7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubash3bQ8BGG7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubash3bQ8BGG7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubash3bQ8BGG7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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