Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M10.6Q85ZW5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M10.6Q85ZW5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M10.6Q85ZW5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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