Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Alkbh8Q80Y20 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Alkbh8Q80Y20 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Alkbh8Q80Y20 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Alkbh8Q80Y20 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Alkbh8Q80Y20 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Alkbh8Q80Y20 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Alkbh8Q80Y20 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms