Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms