Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms