Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms