Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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