Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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