Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms