Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf1Q6PDM2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms