Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms