Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms