Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt39Q6IFX4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Krt39Q6IFX4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms