Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Msl2Q69ZF8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Msl2Q69ZF8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Msl2Q69ZF8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Msl2Q69ZF8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Msl2Q69ZF8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Msl2Q69ZF8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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