Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlh2Q64221 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms