Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms