Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms