Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ecm1Q61508 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ecm1Q61508 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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