Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Usf1Q61069 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Usf1Q61069 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Usf1Q61069 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Usf1Q61069 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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