Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Neurod1Q60867 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms