Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms