Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlha9Q5RJB0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms