Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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