Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5935Q497S0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5935Q497S0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5935Q497S0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5935Q497S0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5935Q497S0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5935Q497S0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5935Q497S0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms