Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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