Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BB287469Q3UT53 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms