Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms