Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms