Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms