Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms