Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U595 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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