Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms