Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c3Q3TMP1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms