Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms