Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Treml4Q3LRV9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Treml4Q3LRV9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Treml4Q3LRV9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Treml4Q3LRV9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms