Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms