Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms