Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms