Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms