Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cnn1Q08091 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms