Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms