Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms