Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms