Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms